Pathfinder es considerada como la versión mejorada de D&D 3.5, algunos la llaman la edición con esteroides de la misma, pero al mismo tiempo son diferentes, creadas por compañias diferentes.
El juego nació tras el nacimiento de OGL y la negativa de unirse a cuarta edición, creando de a poco revistas y opiniones de fans terminó siendo un juego propio. usa el mismo sistema de 3.5, pero con revisión de las reglas de esta y mejoraron varios aspectos de la misma, como el combate, las dotes y los roles de cada personaje :aikido:
El setting per se es Golarion, es lo suficientemente vasto pero puede ser adaptado a cualquier mundo ya sea de D&D como propio.
Sí estás indeciso, vete por Pathfinder, es mucho mejor (a mi parecer) que D&D 3.5